Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM3Q9BZL3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM3Q9BZL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms