Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IFIH1Q9BYX4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFIH1Q9BYX4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFIH1Q9BYX4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms