Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDCA4Q9BXL8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDCA4Q9BXL8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms