Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC106Q9BWC9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC106Q9BWC9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC106Q9BWC9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC106Q9BWC9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC106Q9BWC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC106Q9BWC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms