Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NDFIP1Q9BT67 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms