Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SGIP1Q9BQI5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGIP1Q9BQI5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGIP1Q9BQI5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms