Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBM4BQ9BQ04 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBM4BQ9BQ04 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms