Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PITX2Q99697 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms