Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRAMP1Q96RY5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms