Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNX18Q96RF0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNX18Q96RF0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms