Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A9Q96Q91 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A9Q96Q91 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms