Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PGLYRP2Q96PD5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGLYRP2Q96PD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms