Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRRC1Q96M27 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms