Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC17Q96LX7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC17Q96LX7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms