Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPNS2Q96L46 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms