Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PKNOX2Q96KN3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PKNOX2Q96KN3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms