Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHAMP1Q96JM3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHAMP1Q96JM3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms