Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CELF6Q96J87 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CELF6Q96J87 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms