Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MS4A3Q96HJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms