Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDX27Q96GQ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDX27Q96GQ7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms