Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RNFT2Q96EX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RNFT2Q96EX2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms