Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39LQ96EH5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms