Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C18orf8Q96DM3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C18orf8Q96DM3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms