Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RFT1Q96AA3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RFT1Q96AA3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms