Protein–RNA interactions for Protein: Q96A25

TMEM106A, Transmembrane protein 106A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106AQ96A25 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106AQ96A25 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms