Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NKD2Q969F2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NKD2Q969F2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms