Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TSR2Q969E8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSR2Q969E8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms