Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2A3Q93084 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP2A3Q93084 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms