Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP13Q92995 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP13Q92995 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP13Q92995 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP13Q92995 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP13Q92995 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP13Q92995 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP13Q92995 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP13Q92995 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP13Q92995 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP13Q92995 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms