Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERVK_113Q902F9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERVK_113Q902F9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms