Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DNAAF4Q8WXU2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms