Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAPPC12Q8WVT3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC12Q8WVT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms