Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C15orf40Q8WUR7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C15orf40Q8WUR7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms