Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD1Q8NHV4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD1Q8NHV4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms