Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM58Q8NG06 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM58Q8NG06 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms