Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST2Q8NFU1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BEST2Q8NFU1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms