Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CARMIL3Q8ND23 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CARMIL3Q8ND23 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CARMIL3Q8ND23 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms