Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTL3Q8N8U3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTL3Q8N8U3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms