Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CSGALNACT2Q8N6G5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSGALNACT2Q8N6G5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms