Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAG2Q8N3U4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAG2Q8N3U4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms