Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C17orf53Q8N3J3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C17orf53Q8N3J3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms