Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00269Q8N2A0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00269Q8N2A0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms