Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KSR1Q8IVT5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KSR1Q8IVT5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms