Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms