Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ6

TXNRD3, Thioredoxin reductase 3, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD3Q86VQ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNRD3Q86VQ6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD3Q86VQ6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms