Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRPF39Q86UA1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRPF39Q86UA1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms