Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NPM2Q86SE8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NPM2Q86SE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NPM2Q86SE8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms