Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NEGR1Q7Z3B1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEGR1Q7Z3B1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms