Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM15Q7Z3B0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms