Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTOP3Q7RTS5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTOP3Q7RTS5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms